13 апреля 2004 года Сейм Литовской Республики принял поправки к закону Литовской Республики о Радиационной безопасности (в статьях 9, 11 и 19е), а также поправку к закону Литовской Республики о Переработке радиоактивных отходов (в статье 10). В этих поправках определено, что ЦРБ выдает разрешения на ввоз в Литовскую Республику, вывоз из неё, на транзитную перевозку и на перевозку внутри страны радиоактивных материалов, предназначенных для медицинских учреждений, предприятий, учебных и научных учреждений, государственных учреждений.

Согласно данным положениям, с 1 мая 2004 года, ЦРБ является учреждением, имеющим уполномочия по надзору за перевозкой радиоактивных материалов и радиоактивных отходов (до этого, это входило в сферу влияния министерства окружающей среды Литовской Республики). По этой причине изменилась процедура выдачи разрешений на ввоз, вывоз, транзитную или внутреннюю перевозку радиоактивных материалов и радиоактивных отходов. Эту процедуру регламентирует приказ министра здравоохранения Литвы Nr. V-834 от 26 ноября 2004 о „Правилах ввоза, вывоза, транзитной или внутренней перевозки радиоактивных материалов и радиоактивных отходов.“ Разрешения выдаются и перевозки выполняются согласно требованиям директивы Совета 92/3/Евроатом от 3 февраля 1992 года о "Правилах транспортировки радиоактивных отходов между странами-членами Евросоюза, а также о надзоре и контроле за ввозом в Евросоюз и вывозом из него" а также согласно требованиям регламента Совета 1493/93/Евроатом от 8 июня 1993 года о "Транспортировке радиоактивных материалов между странами-членами Евросоюза“.