Порядок выдачи разрешений на ввоз, вывоз, транзитную или внутреннюю перевозку радиоактивных материалов и радиоактивных отходов в Литовской Республике регламентирует вступившие в силу 11 января 2009 г. Правила ввоза, вывоза, транзитной или внутренней перевозки радиоактивных материалов и радиоактивных отходов в Литовской Республике, утвержденные приказом министра здравоохранения Литовской Республики и начальником Государственной инспекцией по безопасности в атомной енергетике № V-1271/22.3-139 от 24 декабря 2008 г. Разрешения на ввоз, вывоз, транзитную или внутреннюю перевозку радиоактивных материалов и радиоактивных отходов выдаются согласно требованиям директивы Совета «О надзоре и контроле транспортировки радиоактивных материалов и использованного ядерного топлива» 2006/117/Euratom от 20 ноября 2006 г. (OL 2006 L 337, п. 21), а также согласно регламенту Совета «О транспортировке радиоактивных материалов между странами членами Евросоюза» (EB) № 1493/93/Euratom от 8 июня 1993 г.

Выполняя свои функции, ЦРБ в 2007 году выдал:
• 33 разрешений на вывоз радиоактивных материалов из стран-членов Евросоюза;
• 8 разрешений на вывоз радиоактивных материалов из стран не членов Евросоюза (России, США);
• 11 разрешений на перевозку радиоактивных материалов внутри страны
• 17 разрешений на перевозку радиоактивных отходов в хранилище Игналинской АЭ.

Общее число выданных разрешений на транспортировку радиоактивных материалов и радиоактивных отходов в течении последнего года возросло незначительно. Больше всего разрешений выдается медицинским учреждениям. Количество разрешений, выданных промышленным , составляет четверть от общего количества выданных разрешений.